Array 1 17505-18468 **** Predicted by CRISPRDetect 2.4 *** >NZ_JAALMV010000032.1 Clostridium perfringens strain CP-18 32, whole genome shotgun sequence Array_Orientation: Forward Position Repeat %id Spacer Repeat_Sequence Spacer_Sequence Insertion/Deletion ========== ====== ====== ====== ============================== =============================================================================================================================================================================================================================== ================== 17505 30 93.3 35 AA............................ GAAATTAGAGATGCTGGTGAGCATATCTTAGTTCA 17570 30 100.0 36 .............................. CTATGAATTAGCAGAACCAGTTGAAACACCTTTAGA 17636 30 100.0 36 .............................. TACAGGCGATAGATTAAATATGAAAACTGTTTTTAT 17702 30 100.0 35 .............................. GGACAAGAAGTTGAAGGTGCCAGCTTAAAAGAAAA 17767 30 100.0 36 .............................. ATTATCTTATCTTATTCTTAAGAATATGGGATTATC 17833 30 100.0 34 .............................. TAATTGCATATCTTTAGGATTATAACTTATGTCT 17897 30 100.0 34 .............................. ATAAAGGTTATGCTAAATTTGCTAATTTAATATG 17961 30 100.0 35 .............................. ATGAAACTCTAAAGATTAAATAAGGAGGGAAAGTG 18026 30 100.0 223 .............................. CCTTGTAAAATAGCCATTTTAACTTATTAGATTTTTATGAAAACCTAGTTATTTCAATAAGTATATCATAATTTTACCAGTATTTCACGCTTTTTCAAAGTACTAAAATGAAATAATCTTTAAATCCTCTTATTTCAATGCTTAGATCATATTCTCACTATCTTTTTTACTGGTAAAATAATTAATACTAGAGCACTTAAATTTCATAATAATATTTAATTTC 18279 30 73.3 129 C.A.T....G....T..T.....A....C. CCAAAGTATCTCACTATAAGTTACAACTTAAATATTTTTAAAATAATGTTCAACAGCTTCTATGAAGATTTAATATTAAGTTAATGTTCAACTACCATATAAACAAGATAAAAAAGATATTTTAATCAA C [18289] 18439 30 90.0 0 ............TAT............... | ========== ====== ====== ====== ============================== =============================================================================================================================================================================================================================== ================== 11 30 96.1 63 GTTTAAATACATACCATGTTAATGTTCAAC # Left flank : ATTAAAAGCTCTAAGCCTGGATAGTCCTTTAAAATATTAAAACTTAAGCTTTTTATGAACTCCAAAGACTCCTCCTTGCTTTCAAAATAATAAATAGTTTTTCCTCCACCTCTTGTTATAAAATTTTCTTCCTTTAAGCCTTTATTATAATAATCCTCTGAAAAATCCTTAATAATAAGTGAAGCTCCTATAGCATCCTTAAGCTTATTGCTATTAAAAATGTATGTTTGCTTTTTACCTAACTCCCATAAAACTAAACTCCCCAAGGTGCGACACCTTCCTTCCATTTTTTGCTTGCAATAGTATTTTACCACAAATTATTATTATTAATAAATAATACTTTTTTAAACATATTTTAACAAATTAAAAAAATATCAGATAATCCTGTATAAACAAAATTATCTGATAAAAAAGGATATATGGATTTTTAACTTAACTTTAAGTAGATTTTAATATAGAAATTCTTAGATATATGATCTATTAATCTTCAAAAATAAAAA # Right flank : CACTTGTAAAATAGCCATTTTAATTTATTAGATTCTTATGAAAACCTGTCTATTTCAAGAGGTACATTATAATTTTACCAGTGTTTCACACTTTTTTAAAGTACTTAAACAAAACTTGTCTTAATCTCTCTTATTTCAATACTTAGATAATATTCTCAACATCTTTTTTACTGGTAAAATAGTTAACTCTAAATTACTTAAAATTTCATAATAATATTTAAGTTCTTATTGATAAACTACTCTTTTATATTCAATCCCAAGCATCACATTACAAGTTATAGCTTAAACAGTTTAAATACATATTATGTTAATGTTAAACCACTGTAAAATAGCCATTTTAATTTTACCAATATTTATCTTTTTTAAATTTTTTAGTTAATTTTATTAATTAAGTTATAAAAAATAGATAGACCTTAAAATGTGATCTACCTATTTTTCTTTTATTTTTAAATTTATAATGTACTAAAACTATGAAGATAAATTTTGGCAACTTTTTAATA # Questionable array : NO Score: 3.21 # Score Detail : 1:0, 2:3, 3:0, 4:0.80, 5:0, 6:0.25, 7:-2.84, 8:1, 9:1, # Score Legend : 1: cas, 2: likely_repeat, 3: motif_match, 4: overall_repeat_identity, 5: one_repeat_cluster, 6: exp_repeat_length, 7: exp_spacer_length, 8: spacer_identity, 9: log(total repeats) - log(total mutated repeats), # Primary repeat : GTTTAAATACATACCATGTTAATGTTCAAC # Alternate repeat : NA # Directional analysis summary from each method: # Motif ATTGAAA(N) match prediction: NA Score: 0/4.5 # A,T distribution in repeat prediction: NA [Repeat is AT rich:73.33%AT] # Reference repeat match prediction: NA # Secondary Structural analysis prediction: NA [-0.10,-0.20] Score: 0/0.37 # Array degeneracy analysis prediction: F [2-12] Score: 0.41/0.41 # AT richness analysis in flanks prediction: F [85.0-75.0]%AT Score: 0.27/0.27 # Longer leader analysis prediction: NA # ---------------------------------------------------------------------------- # Final direction: F [0.68,0 Confidence: HIGH] # Array family : NA //