Array 1 154417-150845 **** Predicted by CRISPRDetect 2.4 *** >NZ_SMBS01000002.1 Tissierella praeacuta strain DSM 5675 Ga0310507_102, whole genome shotgun sequence Array_Orientation: Reverse Position Repeat %id Spacer Repeat_Sequence Spacer_Sequence Insertion/Deletion ========== ====== ====== ====== ============================ ==================================================================================================================================================================================================================================================== ================== 154416 27 82.1 244 ..G..T...T.T............-... GATGGTTAGAAAAAGATTATCTAGGAATAGTGGATGAGAAAACATCTAATTTTTTTTAAATTATATCTTGTCGACCTATAATAGTGCAAATATTATGAGACAGTGACAAACAGCTATATTTTAATGAATGAAAGTGATTATTTGAAGATTTCAGTAAATAAACACACTAATATAACAAGTAAAATTAGAGATCGACAAAGATGATATATTAACATCAGCAAAATCAATGAGTTGAAAGAAACGC G,AT [154394,154403] 154142 28 100.0 37 ............................ TGATTATTCTGGTGAATTATCTATTATAATTGATAAA 154077 28 100.0 37 ............................ TATAATAAATAATTATAATAATAACTTAATAATTATA 154012 28 100.0 38 ............................ TGTAATTGCATCAGTGATAGGCTTTAACATTGACGAAG 153946 28 100.0 38 ............................ TGCAAGAAACTACGCCTACCCGTTTTAGCTTACAAACA 153880 28 100.0 38 ............................ TAAAAAAAATTTATGTAAACTACATTCAACTTGTAAAT 153814 28 100.0 37 ............................ TTTCTATGTAAAGGATTAAGCGTCCCGTCCACAAGGG 153749 28 100.0 37 ............................ TAAAAAACATATAAATTAAATTATATCATCTATTGAA 153684 28 100.0 38 ............................ TGTAAAACTTCCAGAAGATACATTACCAAGTTGTTTTA 153618 28 100.0 37 ............................ TTAGTAGTAAATCTATACAACAACTCTCCTAGTTCAA 153553 28 100.0 37 ............................ TTTTGTTAGGTACATTAAATAAGTCTATTTCTTCTAC 153488 28 100.0 38 ............................ TGATGATTTTATAAAACTTAAAACCGGCTTTGGTAGCA 153422 28 100.0 36 ............................ TCAATTCATTTGTGACATTGAAGCTGGAAGAAAAAA 153358 28 100.0 37 ............................ TTTATTTAAGCTATTAAGCAATATGAATCCTGTAATG 153293 28 100.0 37 ............................ TTTTGTAATAATTTGTCGAAAAGTTCTTTTAAAAATA 153228 28 100.0 37 ............................ TAGTTAATAAGTCCATAATCCTGTAATGCACCTATTA 153163 28 100.0 38 ............................ TAGTTAATCCGTTATCTACACTCTTGTAAAGTAATGAA 153097 28 100.0 38 ............................ TGTTTTTATATTAAATAAAGAATATGAATTTAAACTAG 153031 28 100.0 36 ............................ TTTAATACTCTTGAATTATCAACTTTATTGGCTAAA 152967 28 100.0 38 ............................ TATTTTTTGCATTTTTTTCTTGAAACTTAATAATTATT 152901 28 100.0 37 ............................ TATTAAAACTATAGGATTTATTCAAGATGATGATATA 152836 28 100.0 38 ............................ TATAATAAATAATTATAATAATAACTTAATAATTATAA 152770 28 100.0 37 ............................ TGCAAAATATGTTGCAGATGCTCAGCTAGTATCTACA 152705 28 100.0 37 ............................ TAGTAAATATGGATGAAGTAGATGAAGTATATAAATT 152640 28 100.0 38 ............................ TAAATCTAACATAGCTTTACAAACAGGAATAAATGCAG 152574 28 100.0 38 ............................ TGAAGATATTGTTTATAATTGGTTCGATGAACAATCAG 152508 28 100.0 36 ............................ TCTCTAAAATAAAAATAAAGGAGATACGGAGATGAA 152444 28 100.0 37 ............................ TACTTTAATTGTGCTTGGAAGTGTATTTAAAGCAATT 152379 28 100.0 37 ............................ TAATGTAAAAAAACAAATGGCAGTGCTTAATGCAGAA 152314 28 100.0 37 ............................ TAATGTAAAAAAACAAATGGCAGTGCTTAATGCAGAA 152249 28 100.0 37 ............................ TATTAGTGCTATTTACGAAGATGATTTACTCTTGATA 152184 28 100.0 37 ............................ TCCGTCAATGTAAACGTCTTGTACAAGCCAGTCTTTA 152119 28 100.0 38 ............................ TTAATGTAAAATAATTAAAATAATTTTATTCTATGTAA 152053 28 100.0 37 ............................ TTTTTATTTAGAAGGTAGCTTAAATTTAGTCCGAACT 151988 28 100.0 37 ............................ TATATCGCAGTATTTAGATGAAAACAAGCCTATTCGA 151923 28 100.0 37 ............................ TCCTTAACTGTGACGCTGTCAGGCTGTTCTGTTACTG 151858 28 100.0 37 ............................ TCCTTGATAATTCTGATATTGGCATCAAGTAAATCAA 151793 28 100.0 38 ............................ GAGTGATTATACAATTGCAGTAGCTGAATATTTAGCAC 151727 28 100.0 38 ............................ GAGCGAGTATGTTGCTTGTAAAGTATTTGTATTTTTAC 151661 28 100.0 39 ............................ GTGTGTAGATAAAATGATTGATGAAGGGTTAAAGAATTC 151594 28 100.0 38 ............................ GGGTTCTCCCCCTCGTTGGGAAGTTGAAATGGTTACTC 151528 28 100.0 39 ............................ GCTTCTATTTCTTCTTCCTTGGATTCTTTTGCTATTATC 151461 28 100.0 38 ............................ ACACTAATTTTTATAATAAACTCATTTAATATCATTTC 151395 28 100.0 38 ............................ AGCAAATAAGGCTCACAATCCTGCTTAATAGTAACTTC 151329 28 100.0 38 ............................ AACTATAGATGTAGATGATTTTTGGTTTTTATGTGTAC 151263 28 100.0 36 ............................ AAAAATATGAACAACAAATAAATTAGCTAAAAACTC 151199 27 96.4 37 .......-.................... ACTTCATAAATTCGCAGGAGGTGAAGTATAGTGGCGG 151135 28 100.0 37 ............................ AAGCTTTATTTTCTTCTTAGGTTTTTCTTTTACCTTA 151070 28 100.0 38 ............................ TAACATATTTAGCCCCATTTACATTATGATAATGATTA 151004 28 100.0 37 ............................ TAAGATATAGAGTATAACATCAATCTACTACGCCAAC 150939 28 100.0 39 ............................ TAAATATACATTTTGGTAAGGTTGTTTTAACACTAATCC 150872 28 82.1 0 ..............T...G..T..GC.. | ========== ====== ====== ====== ============================ ==================================================================================================================================================================================================================================================== ================== 52 28 99.2 41 CTTTAATAGAACTAGAGTAGAATGTAAA # Left flank : GCTGTCTTTAGATATTGCAGAAATATTTAAGCCTTTAATTGGAGATAGGATGATGTTTTCTATGCTCAATAAGAATCAAATAACAGAGGAAGATTTTGAAAGAGAATCAAATTTTTTATATCTTAAGGAATCTGGTAAAAGAAAAATACTTATGGAATATGATAAGAGATTGGAAAGTACAATATCTCATAAAGAATTAGGAAGAGATGTTTCCTATAGGTATCTTATTAGACTAGAGTGTTATAAGTTGATTAAACATATAATTGGAGAAAAAGAATATTCTGGATTTAAAATATGGTGGTGATATAATATGTATGTGATACTTGTTTATGATATTTTGGCAGATGATAATGGTTCCAGAGTATCTAGAAATACTTTTAAAATTTGTAAGAAGTATTTAACTCATATTCAAAAATCAGTATTTGAGGGAAATTTGACTGAGTTGAATTATATGAAGTTGAAAACTGAATTAAATAAACATATTAGAAAGGATAAGGATT # Right flank : CCCCTTTTTGGACAAAATCCTACTTAACATAGATTTTATTAAATACCTATGATGCCTTTCCTAATGTCATAATACTTAGTTCCCTATATTCAATTGGCGTCTTATACCCTAAAGATCCATGAATCCTTAGGTTGTTATACCAATAGATATACTCCGCTAGCTCTAATTGTAGTTGTTCTAAGGTCTCGAATTTTCTTTGATATATGAATTCTGCCTTTAATATTTTATTGGTAGCTTCACTAACTGCATTATTATAGGGGGTTCCCTTATTACTTAAAGATCTTTCTATATTAAAAGTACTTAAAATGTTATCTATTAGTGCATTATCATATTCATTACCACGATCTGAATGGAAAATCTTGATATCTTTTAGGGAGTATTTACATCTTAAAAGAGCTGTCTCTATAAGTTTGGCGTCTTTCTTAGCCCCAGCCGCATAACCAATAATCTCCCTATTATATAAATCTATTAAAGTACATACATAGTTCCATTTATCAGAT # Questionable array : NO Score: 6.24 # Score Detail : 1:0, 2:3, 3:0, 4:0.98, 5:0, 6:0.25, 7:0.01, 8:1, 9:1, # Score Legend : 1: cas, 2: likely_repeat, 3: motif_match, 4: overall_repeat_identity, 5: one_repeat_cluster, 6: exp_repeat_length, 7: exp_spacer_length, 8: spacer_identity, 9: log(total repeats) - log(total mutated repeats), # Primary repeat : CTTTAATAGAACTAGAGTAGAATGTAAA # Alternate repeat : NA # Directional analysis summary from each method: # Motif ATTGAAA(N) match prediction: NA Score: 0/4.5 # A,T distribution in repeat prediction: NA [Repeat is AT rich:75.00%AT] # Reference repeat match prediction: NA # Secondary Structural analysis prediction: NA [0.00,0.00] Score: 0/0.37 # Array degeneracy analysis prediction: R [9-0] Score: 0.41/0.41 # AT richness analysis in flanks prediction: NA [68.3-68.3]%AT Score: 0/0.27 # Longer leader analysis prediction: NA # ---------------------------------------------------------------------------- # Final direction: R [0,0.41 Confidence: MEDIUM] # Array family : NA //