Array 1 1007251-1012461 **** Predicted by CRISPRDetect 2.4 *** >NZ_CP051754.1 Sarcina sp. JB2 chromosome, complete genome Array_Orientation: Unconfirmed Position Repeat %id Spacer Repeat_Sequence Spacer_Sequence Insertion/Deletion ========== ====== ====== ====== ============================== ====================================== ================== 1007251 30 100.0 34 .............................. GATGCAGCAAAAACACTTCCTCCTGGCGAATTAA 1007315 30 100.0 36 .............................. TGGAAATGATAGGTGGCGAGGAGGTCTAGGATATGT 1007381 30 100.0 34 .............................. ATGTATGGCATTAAGATAGATAAGTAGTGCTTCA 1007445 30 100.0 36 .............................. TGGATTTGATTTTGGGATACCAGGTACTATACCTTA 1007511 30 100.0 35 .............................. CTTATATTTGATGTCATTATGCCTAACGTATTATC 1007576 30 100.0 35 .............................. TAAAAAATATTTTTTATGAAACTATTGCTATAAAA 1007641 30 100.0 36 .............................. CCACCTACAAACCTATCTTTTTCAACAATGTATACT 1007707 30 100.0 37 .............................. ATTTGCTATGCAGAAACCGTTGTACAACCTCAACACG 1007774 30 100.0 35 .............................. ATTAGACTACTACTAACGCCTGATATCCACGAAAT 1007839 30 100.0 37 .............................. ATTTTATTAATTACTTTAGTTATATATGGTATATTAG 1007906 30 100.0 36 .............................. ATTTGGTAGTGCCTACCCAACAAGAACTAAATACAA 1007972 30 100.0 35 .............................. AACATCATAACATTCTGAACCTCCCACGACTAAAG 1008037 30 100.0 38 .............................. AAAATTTAACTTTTGAACATCCAATTGAGAGAACAAAA 1008105 30 100.0 34 .............................. TTTAGCAAGTCTTCAGTTAAGGTGTAACCTTTAT 1008169 30 100.0 37 .............................. GCTAAAGACCAAGCAACAAGAGAACTCCATGCAGCCG 1008236 30 100.0 35 .............................. TGGAGTCACAAAGTAGACCAGTATTCCTACTTTGC 1008301 30 100.0 35 .............................. CGTTCATTAGTACTAGGAGTTTGTGTGAACTCTAA 1008366 30 100.0 36 .............................. CCGCTCTCTTTCTTTAAATTTCAACCTTATAAACGC 1008432 30 100.0 35 .............................. TAAAAATATCTTTTACTCATCGTACCCTCCTTTAT 1008497 30 100.0 36 .............................. AGCTAGGAGACGAGCTAAATCATCTAAATCTGTTAA 1008563 30 100.0 35 .............................. GGTAAACAAAAAATAAAAAAGATAGGACAAGAGAT 1008628 30 100.0 36 .............................. CTTAAAAGATATTTATTATCAGAATATAGCATTAAA 1008694 30 100.0 36 .............................. ATTAAATTTTTTGTTATATTATTTTGTGTATTATGT 1008760 30 100.0 36 .............................. TGCAAAACTCTCTATAAATTATTATTAAAGAATTGT 1008826 30 100.0 36 .............................. TTAAATAGACATGATATACAACCACCTTAACTTATT 1008892 30 100.0 36 .............................. AAGTATAACGTAATTGGCATTTCATCTACAGAACAT 1008958 30 100.0 36 .............................. ATACTAGCTGCTCTTAATTGGGTATTGTATGATACT 1009024 30 100.0 35 .............................. TCTCTAATTGAGCTTCTAGTTTTGCTATATTTGAA 1009089 30 100.0 33 .............................. TCAAATTTTTTACTAGTTTTAGAAAGAGAATCA 1009152 30 100.0 36 .............................. CCCTTCGGTCCTTGCTCTCCTTTTTCTCCTTTTATC 1009218 30 100.0 36 .............................. ATAAATAGCGGAATATTAGTGACCACTTATCAAAGC 1009284 30 100.0 35 .............................. AGCAACTCCAAACATACTGTGCTTAATGTATGATA 1009349 30 100.0 36 .............................. AAAAAATGACAGTTGAAGAAGCACAAGAACAAATTC 1009415 30 100.0 36 .............................. TTGAAAAATAAATCTGTATCTAATTCATCAATCAGC 1009481 30 100.0 34 .............................. CTTAACCCCTCTATATTTAAACCTTCTCTACTAG 1009545 30 100.0 35 .............................. CCTTAATGCCTTCCTTCTATTATATTCTAATTTAA 1009610 30 100.0 36 .............................. TTTTTTATCCTTTCCAAAACTGTTAACATTCCTATT 1009676 30 100.0 37 .............................. GGAATATACAAGTTTATTCTACAACCAACCCATTAGC 1009743 30 100.0 34 .............................. TTAGCTTCTTCCAATACTAATTTACCCACTTCTT 1009807 30 100.0 37 .............................. TAACTCTAGCTGGAGAAAGAGTTTCCATGAATGGAGG 1009874 30 100.0 35 .............................. TGAAATGTAAAGGAATTATGCCAACTATAGAATTT 1009939 30 100.0 36 .............................. AAGAGCGTTTTGATACTTTAAAGTTAAAGCCAAAGT 1010005 30 100.0 36 .............................. TTTATATATATACTTTTAATAGTTACAGTATGGTTT 1010071 30 100.0 36 .............................. TCTGTATAGACATCAGAGCCATGGTTGCAGTAGTCC 1010137 30 100.0 37 .............................. GAAGCTGTTGGTGATAAAATTTACGCTATCGGAGGGG 1010204 30 100.0 35 .............................. ATGTTAATAAGAATTTTTTTTATTGCTTTGGTTGT 1010269 30 100.0 35 .............................. TAGCCAAATTTAGTATTATAAAAAAGTATCTTACA 1010334 30 100.0 34 .............................. ATAATAAAATAATTTATTATATTTTTTAATGCAT 1010398 30 100.0 35 .............................. ATTAAATTTATATAAGCATTTTCTATACTTATCTC 1010463 30 100.0 38 .............................. ACTAAGTTTAAAGAAATATATGGCGAAGCTCCAGTAAT 1010531 30 100.0 36 .............................. TTGTTAACTTTATAAAACCCACCACCCACTACACTT 1010597 30 100.0 35 .............................. ACGCTCTTTTTAATGCCTTCGATATCTAAATCTTT 1010662 30 100.0 36 .............................. TTATCCAGCTCATTCCCGAAATGCTCATAAGAAAGA 1010728 30 100.0 37 .............................. TAGATGTAGCACTATCTCCTATTCTAAAACATACTCT 1010795 30 100.0 36 .............................. TAAGGATGTACCCTATAATATCTTAATAGATTTTAC 1010861 30 100.0 36 .............................. TTGTATCTAAATTCTTTTATTATGCTGGCTTGGTCG 1010927 30 100.0 35 .............................. ACGTTTCTCCCCAGGTCCCAATTATAAAGGTATGG 1010992 30 100.0 34 .............................. TTTATAACTTTTTCTATTTCTTCTTCAAAAACTG 1011056 30 100.0 36 .............................. TTGGCTTTAAATAGTAAAGAATCTATTAAAGACTTG 1011122 30 100.0 35 .............................. AAATTGGATATTTGGTTAATACAATAATCTTAGTT 1011187 30 100.0 37 .............................. GATTATATATAAATGTTAATAATTATGTAATAATAAA 1011254 30 100.0 36 .............................. TCTAATAAAAATAATTTAAAAATTTTTTAATGAAGA 1011320 30 100.0 35 .............................. ATATAGAACAAAATGTTCCATATGGAATATTTTAT 1011385 30 100.0 36 .............................. AAAATAATGAAGTTGATGGATATCTAAATCTATATC 1011451 30 100.0 35 .............................. ACAGACGCACAGGCTAATGTAAAGGCTTTTGTCGG 1011516 30 100.0 35 .............................. CACTCCTTGCTATTTATTATTATTCTATCTTCTAC 1011581 30 100.0 38 .............................. TGTATTTCTTGCCTTTTAAGTAACTTGCACCCGTTTAC 1011649 30 100.0 35 .............................. GGTGCTAAGCTTTACCTTTGTTTGTTTATTATTTT 1011714 30 100.0 36 .............................. TTAAACTTTTTAGCTGCCATTCCATAATCTTTGGCA 1011780 30 100.0 35 .............................. AGTAAGTTTTTATATCTATCTGTTAAATCGTATAA 1011845 30 100.0 36 .............................. ACATTATTTAATCATCTCCTTTTTTTGAATTTAATA 1011911 30 100.0 33 .............................. CCGTTGTATATAACTTTAAATCTCCACTATTGT 1011974 30 100.0 36 .............................. TTTTTATATGCTTGTAATAAACTATCCTCCACATGC 1012040 30 100.0 35 .............................. TTAAACCTTAAACCTTCTACCGTTACCCTAGTACC 1012105 30 100.0 36 .............................. CATAAAAACGCTACTTTCTATGCAGTTCTCCTATGA 1012171 30 100.0 35 .............................. TTGAAAAAGAATTTATAAGTCCAGTTAGCTTTATC 1012236 30 100.0 36 .............................. TTCTAAAGCTGTAAAATCAAAATTTTCCTTTATTAT 1012302 30 100.0 36 .............................. GAAATTTACGAAAGTTATATACATAGCAGTGCATGG 1012368 30 100.0 34 .............................. ATATCTTTATTTTTAGAGTCTACTAAAAAATAGT 1012432 30 100.0 0 .............................. | ========== ====== ====== ====== ============================== ====================================== ================== 80 30 100.0 36 ATTGAAGAATAACATTAGATGTATTTAAAT # Left flank : CTTAAAATGTTTAACATTAAGGAGAAAATGTAGAAATGAAAAAAAAGATAAACTATAATTATGCATTTTTATTTTATGATGTTAAAGAAAATAGGGTAAATAAGGTTTTTAAAATATGTAAAAAGTATTTAAGTCATTATCAAAAATCAGTTTTTAGAGGAGAAATAACCCCTTCAAATTTAATAAAATTAAGAAAAGATATAAAAAATGTAATTGATGAAACAGAAGATTTTATTTGCATAATAAAATTATTAAATGATGGAATGTTTGGAGAAGAAATAATAGGAGTAGCTAATAAAACAGGAGAAGATTTATTTTTATAATATATTTACCAGGTAAAAACAATTTTAATTTTTTAAAAGCATGATTATTAAAGGCTTTAAGATTATTTTTAAAAGTTTATAGAAATTTTTTTGATTACTTGGTAAAATATTATTAGAAAGTGATAAGTAAAGGCTTAACAGGGAATTAACTATTTTAAAAATGGCTTTTTTACAGTG # Right flank : TTGCTAATTGGTTGGTAATATTCTTTCTTTTTATGTATATAAAAATTATATCAAAGAGGTAGATTTAATTAAGAATTAAATTTTTATCGTTTTAATTTAGTATTTTAAAGTTTATAATATAAGTATGACATATAATTTTTAAGATATAAATAAGGAAGTGAGTGAAATGGAAGAAAATTTAAAATTAAAAGAAGAGCTAAAAAGTGAAATTAATAAGGAACTTTATGATGATTTAAAGAATATTACACAAGAGGTTGCAGGAAAAGTTAGAGAAGAAATAAGTTATGATAGTATAAAAAATCATGAAAAAGCCCAAATAAATGAGGAAGTTTTAACTATGGCTAATAATAATGAGATTAGCAAAGAATTAAATAATTCGGTTGATAAGCTTATAAAAGAAGATAGAAAGCTTAAAAAAATGTTTTTAATAGATTTAATCGGTTGTACTACTATGTGTGCTGCTACAATTTATCTTTTACATAAAAAAAGAAAATAAAAAT # Questionable array : NO Score: 6.26 # Score Detail : 1:0, 2:3, 3:0, 4:1.00, 5:0, 6:0.25, 7:0.01, 8:1, 9:1, # Score Legend : 1: cas, 2: likely_repeat, 3: motif_match, 4: overall_repeat_identity, 5: one_repeat_cluster, 6: exp_repeat_length, 7: exp_spacer_length, 8: spacer_identity, 9: log(total repeats) - log(total mutated repeats), # Primary repeat : ATTGAAGAATAACATTAGATGTATTTAAAT # Alternate repeat : NA # Directional analysis summary from each method: # Motif ATTGAAA(N) match prediction: NA Score: 0/4.5 # A,T distribution in repeat prediction: NA [Repeat is AT rich:83.33%AT] # Reference repeat match prediction: NA # Secondary Structural analysis prediction: NA [0.00,0.00] Score: 0/0.37 # Array degeneracy analysis prediction: NA [0-0] Score: 0/0.41 # AT richness analysis in flanks prediction: NA [71.7-78.3]%AT Score: 0/0.27 # Longer leader analysis prediction: NA # ---------------------------------------------------------------------------- # Final direction: NA [0,0 Confidence: NA] # Array family : NA // Array 2 1146487-1142916 **** Predicted by CRISPRDetect 2.4 *** >NZ_CP051754.1 Sarcina sp. JB2 chromosome, complete genome Array_Orientation: Reverse Position Repeat %id Spacer Repeat_Sequence Spacer_Sequence Insertion/Deletion ========== ====== ====== ====== ============================== ====================================== ================== 1146486 30 100.0 35 .............................. GCATTTACAGCCTCCTTAACAACCTCAACATTAGC 1146421 30 100.0 36 .............................. GCAATTTTATCTGCTTGATGTTTGTAGTTTGGGTGA 1146355 30 100.0 37 .............................. TTAATGAGTCTGCTGATAGAATTTTTGATAAGTATGG 1146288 30 100.0 35 .............................. GATATTGTAAGACTTCTTGAAACTCCACTTAATAA 1146223 30 100.0 35 .............................. GGGTTTGATGTAAGTAATAAAATAAAGGCTTTAGT 1146158 30 100.0 34 .............................. CCCTCTAGCGTTTCTACTAGATAGTCCTTGATAA 1146094 30 100.0 34 .............................. TGAGAAATAAGAAAGTGGAAAATATAGTAAAAGA 1146030 30 100.0 36 .............................. TAAGTTTTACCATGATCCTGACAGAAAGGACAGTGG 1145964 30 100.0 37 .............................. CTTAGCATCTGCTGTTATTAGAGGTTTTGTAAGTAAT 1145897 30 100.0 36 .............................. TCTTAATTCTATCCCCTTACATTTAATAAGTTAAGG 1145831 30 100.0 34 .............................. GTAAATAGATTACCATGTGTATGATTTCTAAAGT 1145767 30 100.0 36 .............................. AAAGAGAGGTTATGATTTTGAAATTGTATCACTAGC 1145701 30 100.0 35 .............................. CCAATTTTATTACTTTCTATTAGCTGATCTAAATC 1145636 30 100.0 38 .............................. TTAGTATGTAATTTAAATGATGCACTAACTTATATAGT 1145568 30 100.0 36 .............................. CCATTTGATTTTTGCAAGAAGTATTTATTGTTAGCA 1145502 30 100.0 36 .............................. GGAGTAGTTGTTCACAATTGTATAGACCCAACTGTT 1145436 30 100.0 36 .............................. ATAAAATAGTAGATTTTGTAAAGGGGAGATTTTAAG 1145370 30 100.0 35 .............................. TCTAGTAGAACCTAGCTTTATATCGTCCTTTCCTA 1145305 30 100.0 35 .............................. AGCTATGAATAACATGAATGAAAACTTTTCAAGTG 1145240 30 100.0 35 .............................. ACTTCAACAATTGTTGATATTAACTTTTTAGACTC 1145175 30 100.0 36 .............................. TCTAGCTTTGGTATTATGTCTTATGGTACTACTATG 1145109 30 100.0 36 .............................. ACACTTTTGGAAAAAAATTTTTTAAATAATTTTTTC 1145043 30 100.0 36 .............................. TTCTATTATAGCAATAAAAAAATTATATAAAAACCC 1144977 30 100.0 36 .............................. CCTTAATATTAAGTTATCAAAGAACAATTTCATCTT 1144911 30 100.0 35 .............................. ATTTCTCTCTTTAACTTAACTTCCATATTTTTTAT 1144846 30 100.0 35 .............................. AACGACACAGTTGTAGGAATTATATCCGTCCATAA 1144781 30 100.0 33 .............................. ACAGTATCTTGAAATGTAAAAGTAAACGTTAAA 1144718 30 100.0 38 .............................. AATGAAGTATGTAAAATATGTGGCAGTGATGTTTTTGC 1144650 30 100.0 36 .............................. TATAATTAACTATTTATATTAATTCTCTGCAAAAAA 1144584 30 100.0 37 .............................. TTGTGTAGAATAATTTTTTGTTACCATAGCATTATTG 1144517 30 100.0 36 .............................. GTATTTTGTTTTTGTAGTTGTATATACCAATTTTCT 1144451 30 100.0 35 .............................. ACAATTTAGGGATAACCAAGGAAATGTTAGACTTC 1144386 30 100.0 36 .............................. CGATATTAAGACAGCAGTGCAACAAATAGATACTGT 1144320 30 100.0 36 .............................. AAAGGTTTCGCACTAGGAAATGGTATGCCTTGAATG 1144254 30 100.0 35 .............................. TTATCAGAAACTAATGTATTAATGTTTGCTTTTAC 1144189 30 100.0 35 .............................. GACCCAGTTCCAGGAGTTCCACTATTGCTATTAAA 1144124 30 100.0 36 .............................. AGTCTTGAAAGCTTTCACCCGAAACTTTTTTTAATG 1144058 30 100.0 36 .............................. CCTTTATCTCCTTTATTACCTTTTAAACCTCTTTCT 1143992 30 100.0 35 .............................. ACATAACAAGAATCAACAATAGCACTATTTCTATT 1143927 30 100.0 35 .............................. TATAGCTAGAGGTATTAACTTTCCCTAGACTTAAC 1143862 30 100.0 36 .............................. GTTATTATATTCCCAAAATATTCAATCAAGGCTGTT 1143796 30 100.0 35 .............................. TACGCTCTCTGACAAGCCGAATTAATCGTATGATG 1143731 30 100.0 36 .............................. TATCCATGTTCCTTAAAATCCTGTGGAATATACATA 1143665 30 100.0 35 .............................. GCAAGCAATGAAAGGGAGTGCTAATTAATGGCTAT 1143600 30 100.0 35 .............................. AAAATAGGAACATTATACGATTTTGCAATCCTCAA 1143535 30 100.0 35 .............................. AGAAAATGAAACTTTTGAAAATTTATCTATAAAAA 1143470 30 100.0 36 .............................. TAAAATGCCTTATAAAAAAATATTTTACTGTAGTTT 1143404 30 100.0 36 .............................. TAATATCTACCTACCTTTTTAAATTATTTTAAATAA 1143338 30 100.0 37 .............................. TACAATTCTCTGCATCCTGCTTCTGTTTTTGTTAATT 1143271 30 100.0 35 .............................. TCTCGTTAGCTGCTTTTGTTGTGAAAGTTAATACT 1143206 30 100.0 36 .............................. AGGGGGTAAAGTATGGGTATAGCATTAATGAATACA 1143140 30 100.0 35 .............................. AAAATTTTAACATTTTCCCTATCTATATGCCAAAA 1143075 30 100.0 36 .............................. TTAAATCTACCTCCTTAATTGTTATACTATAATTAT 1143009 30 100.0 34 .............................. TTATATATATAAATAGAATACGTTTACATCATTA 1142945 30 96.7 0 .............................C | ========== ====== ====== ====== ============================== ====================================== ================== 55 30 99.9 36 GTTAACTAAGAACATTAGATGTATTTAAAT # Left flank : TTTAGGAAAAACAAATCATCCTGCAACTATTAAAAATGTAGAAATTCTAGAGAAAAAGAAAATAAGTAATGATAAGATAAATATAAACAGTTTATTTTTATCAGACAAAGCGGTAAAAGTTAAAAATAAAGGTTTTGGTAATAGCAACTTAAATGAATTTATATATAAAGAGGTACTTCCTGTTGCTTATACAGATAATAAGTCTTTATATGTATCAAAAAGTTTTACATTCAGCAATGCTAAATTTAACATTGGAAATAACGAGGAGTTTTTAGAAGTTAATGGATTAAATCTATTTTTCTTTTAAAAATTGTAACAGTTTGATTTACCAAGTGAACTTTTTATAAAAATGCCGTATAATATAGGCATATCAAACATTTATGTGTGATTATATTATATAATTTAATAAATTAGTTTTACTTGGTAAATATTTTTATAAATCTAGTTATATCAACAATTAGATGGATTTATAAAAATGTAAGAATGGCTTGTTTAAAGTG # Right flank : TTATAAAGTAAAAAGATGTTGATGTATTCTTTAATTCAAGGAAATAAAATGTAAAGAATTAAAAAAATATTAAATTCCCAGTATTCGAAGGTATCAAGTTAGATAAAAATAAAGAGAGTTATAATTAAAAAGGTGGTATTAAAATGTATTATTCAAAAAAGGATATAAAAATATTATTAGATAAGATTGACAACGAACAAGATAAATTCTTTATTCTTGCTATATATAATTGTATAAGAGGTCGTTCTTACGAAGATTTGGCTGAATTAAAGGTAACAGATATAAATTTTAATAAAAAAGAAATATATGTAAATGGAAGAACTGTAGAGATGGATGACTATTTTGTTGAAGTAACTAAAGAAGCTCTAAAACAACAAATATATCGTAAAAAAGGAGATAAAGCTAATCATAAGGAATATGAAATAAACACTAAAAGTGAATATGTGTTAAGACCGAAGCCTTGTGTACAAACAGCTAATGGCTTAGCACCATATTCCCCA # Questionable array : NO Score: 3.26 # Score Detail : 1:0, 2:0, 3:0, 4:1.00, 5:0, 6:0.25, 7:0.01, 8:1, 9:1, # Score Legend : 1: cas, 2: likely_repeat, 3: motif_match, 4: overall_repeat_identity, 5: one_repeat_cluster, 6: exp_repeat_length, 7: exp_spacer_length, 8: spacer_identity, 9: log(total repeats) - log(total mutated repeats), # Primary repeat : GTTAACTAAGAACATTAGATGTATTTAAAT # Alternate repeat : NA # Directional analysis summary from each method: # Motif ATTGAAA(N) match prediction: NA Score: 0/4.5 # A,T distribution in repeat prediction: NA [Repeat is AT rich:80.00%AT] # Reference repeat match prediction: NA # Secondary Structural analysis prediction: NA [0.00,-0.90] Score: 0/0.37 # Array degeneracy analysis prediction: R [1-0] Score: 0.41/0.41 # AT richness analysis in flanks prediction: NA [81.7-75.0]%AT Score: 0/0.27 # Longer leader analysis prediction: NA # ---------------------------------------------------------------------------- # Final direction: R [0,0.41 Confidence: MEDIUM] # Array family : NA //