Array 1 17026-14025 **** Predicted by CRISPRDetect 2.4 *** >NZ_JACJSB010000047.1 Dolichospermum sp. FACHB-1091 contig47, whole genome shotgun sequence Array_Orientation: Reverse Position Repeat %id Spacer Repeat_Sequence Spacer_Sequence Insertion/Deletion ========== ====== ====== ====== ==================================== ============================================ ================== 17025 36 100.0 34 .................................... ATTCTATATTGTTCTAACTCTAACACATCATGTT 16955 36 100.0 40 .................................... TTCTGTCCACGTCATAGGTGTGACAGGTTGTGATGGTGTG 16879 36 100.0 35 .................................... TTCTGAACTTACGTTTTGTATGTTGTGGTATCTCA 16808 36 100.0 36 .................................... TCCAGGAAGCTATCTACCTAGCAATAAGGCATCTAC 16736 36 100.0 34 .................................... TTCCAAGCTTCATACAAACAGGTAGCAGTAAATT 16666 36 100.0 38 .................................... TTTAAGCTGCTCAGACTTAAATCCCTTCCCTTTAGTTG 16592 36 100.0 37 .................................... GGCGCGATACTTAGGACTCATCTCACCCAGCCGTTTA 16519 36 100.0 36 .................................... AAAAAATCTTTAGCACTAAAGCAGAAGTAATTAAAC 16447 36 100.0 37 .................................... TTGTGTTTCGTGAGCTTTGTCACTTGACCATTTAATT 16374 36 100.0 39 .................................... TTTTCTTGGCAGAGAGGAGAAACAAGAATCCAACTAATT 16299 36 100.0 34 .................................... TTAAAATCTCGTCGCTTACCCCCACTTGCTTCAT 16229 36 100.0 35 .................................... GGGTTATCGGTTGGTAGCGAAGATTTCGGATTTTG 16158 36 100.0 35 .................................... TATATTTAGTAAGTTTTTTAAAACAGTTGCGTAAT 16087 36 100.0 35 .................................... TTTCAACCTCAGAGGTTAACTGCTTAATCGTCTCC 16016 36 100.0 42 .................................... GAGGTAATCCCCATAGGATTTCTAATGCACGATTGCGCGTGT 15938 36 100.0 37 .................................... ATTTGTAGATACTTTCCAACTTTTAAGATGTTTGCGT 15865 36 100.0 41 .................................... GAAATCAGGTTTCCCGTAATCAGGTTTTCTGATTGTGGAAA 15788 36 100.0 43 .................................... AACCAGTGAATAAGATAGTTTCGCCTTCATGTCCTCTGTTTGT 15709 36 100.0 36 .................................... GTCAAGGCCGCGATACCCGCCTGGATTATGGCGAAT 15637 36 100.0 36 .................................... TTTGTTACGCTATCCGCAAATCCAAAACCATCCATC 15565 36 100.0 37 .................................... TCTAACTTATTAGACAACTCAGTAGGTTTACTATCTG 15492 36 100.0 36 .................................... ATTCCCGTCAGTTGTGGTTTGGGGAGTAAAAAATGA 15420 36 100.0 44 .................................... TCAGCGGGAGACATTGTGCGAGTAAAGTTAGCGGCTTGTACCGC 15340 36 100.0 37 .................................... AACCATCGGTTGTATAGAACCGGAATGTTGTAATGTT 15267 36 100.0 36 .................................... TTATTAATCCTCAGAAAAACGCTACCGATCGCAGCG 15195 36 100.0 36 .................................... TATAAGTCGGCAATATCTTGAGGGCTGGGTGGTAAT 15123 36 100.0 35 .................................... GTCAAAGGTGAAAAGTCCCCATTCTAACTGCTGTT 15052 36 100.0 37 .................................... CCTTCCAGGTTCTTACTTTTTTGGCTCACCACCTAAT 14979 36 100.0 36 .................................... ATTGTAGGTAGTAACTGAGCAATTTTGTGAGATTCT 14907 36 100.0 37 .................................... TTAGACGATTTTTACAGTAAGCGTACTTGGAATCAAG 14834 36 100.0 37 .................................... TAGTTTAAGGGCATTAGGAGCATTAAGATACAACCTA 14761 36 100.0 41 .................................... AATTAAGGGCATTTCTGAAGAGTAGGCTAGTTGCCAGGAAA 14684 36 100.0 35 .................................... GCCAAATGGGTGGCTTGTGCTGTGATACAGGGTTT 14613 36 100.0 34 .................................... TTTAATCCTCTGGCTACTTCATCAATGTTTTTTA 14543 36 100.0 35 .................................... GTCGTGGTGCCGGTTATATTCCTGCAAATAGCTTT 14472 36 100.0 43 .................................... CGCTAACCATTCCGTTTGTTCTAGAGAATCTAGTAGCATAAAT 14393 36 100.0 36 .................................... TAATTTATTTCTCCATTCACTTTCTGGAATATTAGA 14321 36 100.0 11 .................................... ATCAGATATAA Deletion [14275] 14274 36 100.0 36 .................................... TAAAGAACTACCTTTCAATGTAAATGATGCAATTAT 14202 36 100.0 39 .................................... GTCATGATATTGAATGCTTATCCCATAAAATTGTTCATC 14127 36 91.7 31 T.T...............T................. CCTGCAAAAATGAAGAATTAAGAATGAAGAA 14060 36 94.4 0 .............A....T................. | ========== ====== ====== ====== ==================================== ============================================ ================== 42 36 99.7 36 GTCCCCACTCGCTGGGGACATTAATTGAATGGAAAC # Left flank : TATCGAATTGATTGATTTTTTCGGATGTTTGTGTTATGTTTTTGTATGTGATTTCCTACGATATTCCTGATGATAAACGCCGGAAAAAAATAGCTGATTTATTAGACGGTTATGGTCAGCGGGTACAGTATTCTGTATTTGAATGTCAGTTAAGTAGGGAAAAGTACAATGATTTCCGTCGTCGGTTAAGGAAGATTGTCAAGTTGGAGGAGGATAATGTCAGGTTTTATCCTTTGTCTCGACATACTCTTTCCCAGGTGGAAACTTGGGGGGTGGGTGTGCCTGTGATTGAGCCTCCGGGTTCAATTATTGTGTAGTTTTTCCGAAGGTCGGGTAAAATGGCTGTAATGTTGATTTTTTGGTTGGGAACTTCGGTCGCTTGCTGGGTAAGGGTTTTGGGGGTTTTTTTCCGCTGTCGGTTGGTGGTTTTAACACTTTTTTTCCTGACCTTCGGAAACTGTCTCTGGACACCTTGCTGGGTAAGGGTTTAAAATTGAGGG # Right flank : AATGACCATTAGCAGTATATATAAATACATAATAAAATATGTACTGATATTTTGAGAATCAGTACATTTTAACTATCAATCAATGTTTGGTAAGGGAAACGCTGTAACTTGATAGCAGCATAAATAAGAACCAATGTCAAAGAAAATAAAATATTTTTAATAAAGTCCTCAAAGTGACGAAAAGCTTACAGAGTAAGGGTTAGAGCAAATATTACAAAAATCTTGAGATATTTTAGATTCCTAGACAAACACTGAATCGCGCTCTTATAATTCATCTATAAGCTAGACAGGGGATCTACCGATGACAGCAGAATATTGGCGGGCTAAGATTTGGGGGTTACTACATGACCCTGTATTAAAGGCATTACATGACAATAGCGGACGGGGTAAAAATAGCTTCTATAAACAACTAGAAGTAATGAAGCCTTGGGTTGAAATTGGCAGAACCCCCGATGATTCTTGTGGTAAAGCATTAGCAAATATCCTATTAGCAGATCATG # Questionable array : NO Score: 6.21 # Score Detail : 1:0, 2:3, 3:0, 4:0.99, 5:0, 6:0.25, 7:-0.03, 8:1, 9:1, # Score Legend : 1: cas, 2: likely_repeat, 3: motif_match, 4: overall_repeat_identity, 5: one_repeat_cluster, 6: exp_repeat_length, 7: exp_spacer_length, 8: spacer_identity, 9: log(total repeats) - log(total mutated repeats), # Primary repeat : GTCCCCACTCGCTGGGGACATTAATTGAATGGAAAC # Alternate repeat : NA # Directional analysis summary from each method: # Motif ATTGAAA(N) match prediction: NA Score: 0/4.5 # A,T distribution in repeat prediction: R [8,10] Score: 0.37/0.37 # Reference repeat match prediction: NA # Secondary Structural analysis prediction: NA [-1.50,-1.50] Score: 0/0.37 # Array degeneracy analysis prediction: R [5-0] Score: 0.41/0.41 # AT richness analysis in flanks prediction: F [78.3-51.7]%AT Score: 0.27/0.27 # Longer leader analysis prediction: NA # ---------------------------------------------------------------------------- # Final direction: R [0.27,0.78 Confidence: MEDIUM] # Array family : NA // Array 1 104273-94648 **** Predicted by CRISPRDetect 2.4 *** >NZ_JACJSB010000007.1 Dolichospermum sp. FACHB-1091 contig7, whole genome shotgun sequence Array_Orientation: Reverse Position Repeat %id Spacer Repeat_Sequence Spacer_Sequence Insertion/Deletion ========== ====== ====== ====== ======================= =========================================================== ================== 104272 23 100.0 50 ....................... TCCAATATTGAAAAAGTTAGCAATCTGCTTGATTACGTTTCTAACTAAGT 104199 23 100.0 49 ....................... TACCATTAAAGTGCAAAAATTGCATTTTTCATAAAGTTTCTAACTAAGT 104127 23 100.0 49 ....................... ACAGGACTTTCTACATATAAACCTAAAGGTAAGGCGTTTCTAACTAAGT 104055 23 100.0 48 ....................... ATTGCTTGCAGTTGATTCGGCACTTGAGCTAAAGGTTTCTAACTAAGT 103984 23 100.0 53 ....................... AAAGTTTCAAGACCGATGATTTAGCTGATAGTATTAACAGTTTCTAACTAAGT 103908 23 100.0 52 ....................... TTCCCAAGTTGGTAGAGAACACCGGACAAATGTTGGTTGTTTCTAACTAAGT 103833 23 100.0 52 ....................... ATTCAATATTTTTTTGAAGGGCTGGGATACTCAAAACTGTTTCTAACTAAGT 103758 23 100.0 53 ....................... CTGATTTAAACACTTCAGCATTAGCTTTAGAGTCAGGTGGTTTCTAACTAAGT 103682 23 100.0 54 ....................... TAGACAAAACCACTAATTCATGGATAGAAAATTTCAGTAGGTTTCTAACTAAGT 103605 23 100.0 53 ....................... AAATTAGGGCAAAACGGTCAGCCTTGGGGACATTCTCTTGTTTCTAACTAAGT 103529 23 100.0 48 ....................... TTTAGCGGAAACCGGATCTCAGATGGCGGATGCGGTTTCTAACTAAGT 103458 23 100.0 51 ....................... ACGGGAATAGTTACAGTATAACTGCACCCAAAAGTAGGTTTCTAACTAAGT 103384 23 100.0 55 ....................... AGGACCAGACGACAGAGCGTCATGAATCACGTTGCCGAGCTGTTTCTAACTAAGT 103306 23 100.0 52 ....................... TTCGATCATTCTAATTAATTGTTTATTCATGCTTCTATGTTTCTAACTAAGT 103231 23 100.0 50 ....................... TATCCATTTCGTTTTGATTAGTAGATGTATTCTCATGTTTCTAACTAAGT 103158 23 100.0 49 ....................... TTTCTTTATTAGTTTGATTTTCTTCTATATACGCAGTTTCTAACTAAGT 103086 23 100.0 51 ....................... TCGGCATTCATAATGCACCTACTACAGAATATGTTTTGTTTCTAACTAAGT 103012 23 100.0 49 ....................... GTTAACAAAATAGATTTAGTCAACTATTATAAAGAGTTTCTAACTAAGT 102940 23 100.0 53 ....................... ATGAATAAGTAACGGGGCTTGCCATGCCCCGCTTAAGTAGTTTCTAACTAAGT 102864 23 100.0 56 ....................... GTCATGATGTGTGTGTGTGATGTGTGTTTTGAGTGCGAATGAGTTTCTAACTAAGT 102785 23 100.0 55 ....................... TCAACCCGGTTTTATTCCGGGTTTTATTATTAAAAGCAGTCGTTTCTAACTAAGT 102707 23 100.0 50 ....................... GAGATTGAGGAGAAGGCTAAACCCAGTCATCAACAAGTTTCTAACTAAGT 102634 23 100.0 53 ....................... CTGAATCAAAAATCATTGACGCTGAATACCAAATAGCATGTTTCTAACTAAGT 102558 23 100.0 50 ....................... AAGCCAGTCTAAAGAATTAGAATTAATGCAATCAGAGTTTCTAACTAAGT 102485 23 100.0 52 ....................... AAATGAATTGGTCAAAAGCTATGGTTTCAATAGCCAAAGTTTCTAACTAAGT 102410 23 100.0 48 ....................... ACGCGATCGCGCCCTCAATATCCCCAATTCTCAAGTTTCTAACTAAGT 102339 23 100.0 52 ....................... CATCACTAGCACGTCTGCCTAATCTGTCAAGCTTCAACGTTTCTAACTAAGT 102264 23 100.0 53 ....................... TGGTAGTGAGTCTATTACCCGGACTAATTGATATAGGTGGTTTCTAACTAAGT 102188 23 100.0 47 ....................... TCTTCAAATTGCCAGAAGGTATCACGTACCAATGTTTCTAACTAAGT 102118 23 100.0 52 ....................... AAAAAACAGAATCGGACTTGTACTAATGATGAGATAAGGTTTCTAACTAAGT 102043 23 100.0 53 ....................... TTTACAAATTGGATGTTTAAATTTGCTTTTTACTTGATTGTTTCTAACTAAGT 101967 23 100.0 49 ....................... ATTACCACCGATGTAGAGACAATAGAAGTAGGACAGTTTCTAACTAAGT 101895 23 100.0 50 ....................... ATTTTCTATCAAGATATGGTTGTAAAATAACCCTTTGTTTCTAACTAAGT 101822 23 100.0 50 ....................... TTCACACTCAAGATAGTAATGGATTAGCAAGGTTTTGTTTCTAACTAAGT 101749 23 100.0 50 ....................... CATTGCAAATCACATCTTTTATGATTTTTCCATCTGGTTTCTAACTAAGT 101676 23 100.0 50 ....................... ATGCAATCAGTAATTCCCAGAATAGCGGCTGTAGAAGTTTCTAACTAAGT 101603 23 100.0 52 ....................... ATAAACGATCGCCTGGTTGAATGGGTTGAAATACCCTTGTTTCTAACTAAGT 101528 23 100.0 59 ....................... TAGAAACATAAACGATCGCCTGGTTGAATGGGTTGAAATACCCTTGTTTCTAACTAAGT 101446 23 100.0 48 ....................... TTTAAATTTTCGGGTAGATTTTCAATCTTTTTAAGTTTCTAACTAAGT 101375 23 100.0 53 ....................... CTGTATTGGATAATAAATTGTTAAGGTGAGCGACTTGAAGTTTCTAACTAAGT 101299 23 100.0 49 ....................... CTGAGGCTTCTATTAATTTTTTGAGTAATCGGTCTGTTTCTAACTAAGT 101227 23 100.0 49 ....................... GATTACTCTATCTTCTAAGAGATTGAAATTTCCCAGTTTCTAACTAAGT 101155 23 100.0 49 ....................... ATTCCGTCTGGAGTGCCAAACACGGTGAGAATAGTGTTTCTAACTAAGT 101083 23 100.0 49 ....................... ATTCCTAAAATTTGCGAGAATGAAAAACCACAAAAGTTTCTAACTAAGT 101011 23 100.0 52 ....................... GCAATTCGGGAACCATCTGGGAATCCTGATTTTTAGAGGTTTCTAACTAAGT 100936 23 100.0 51 ....................... AACCGCGCGCCGGCATTTTACTTCTATTTCCTTGAGGGTTTCTAACTAAGT 100862 23 100.0 48 ....................... GTTTCTACATCTATTTTCTGATATTTAAACTCATGTTTCTAACTAAGT 100791 23 100.0 49 ....................... GAATCTTTGTTCACCCTGTTGAAAATTGGAAAACAGTTTCTAACTAAGT 100719 23 100.0 50 ....................... TCTACACCTGATAATATAGGTTTATAATCGTTAATTGTTTCTAACTAAGT 100646 23 100.0 50 ....................... TCGTGGGATAAACATTCCTTAACATAATTAACAGCAGTTTCTAACTAAGT 100573 23 100.0 51 ....................... AATGATGATTCAAATGTATTTGTTAGTTATATTCCAAGTTTCTAACTAAGT 100499 23 100.0 50 ....................... TTTCTATTTTGTCAGTAGGCTTTTTAATTGGATTTTGTTTCTAACTAAGT 100426 23 100.0 54 ....................... TAATCGTCAAGTGGTTCAGATGGTAGAATTTTATTTTAAAGTTTCTAACTAAGT 100349 23 100.0 53 ....................... ATGATCATATTCTCGAATTAGAGGGTGAAAATAGTTCTGGTTTCTAACTAAGT 100273 23 100.0 48 ....................... TTTGGTTTTATGTCCAGTTCCTTGGTTATTAAGTGTTTCTAACTAAGT 100202 23 100.0 50 ....................... GACAAAATTGACATTTCTGGAGAAAAATTGACATTTGTTTCTAACTAAGT 100129 23 100.0 50 ....................... AGGACAAAAAGCGGTTTTTTGCACCTAATTTTATTGGTTTCTAACTAAGT 100056 23 100.0 53 ....................... AATTTGGCGGTGCCGTTGGCGGCCGGGCTTGTAATGTCGGTTTCTAACTAAGT 99980 23 100.0 51 ....................... AAAAATAAGATCCGCGGGCCTTACCTTTGGGTTTATAGTTTCTAACTAAGT 99906 23 100.0 48 ....................... ACAAGCAATTGAGAAATTACCGCGAAAATCATCTGTTTCTAACTAAGT 99835 23 100.0 52 ....................... TAGAGATTTCTATCAACCTAGCATGAGTGACCTGTTCAGTTTCTAACTAAGT 99760 23 100.0 50 ....................... ATCGCTATAGGTTGGTTGCCAAAATTCGTAATCCACGTTTCTAACTAAGT 99687 23 100.0 52 ....................... TTTTCTCTTTTTTAACCATTGTTTTAAGCTAGGATATTGTTTCTAACTAAGT 99612 23 100.0 50 ....................... TGGCGGGCTGGGCTGGGCTGGGCTGGGCTGGGCTGGGTTTCTAACTAAGT 99539 23 100.0 51 ....................... ATGACGTATACAAAGCTGATACTCTCACTGCATTTACGTTTCTAACTAAGT 99465 23 100.0 51 ....................... TCGCTATATAAGGGTGTTTCGGGCTGTGGTACTAGTTGTTTCTAACTAAGT 99391 23 100.0 53 ....................... AAATATAAGCAGAAAACCAACTGCTAGACAAACTGGTTAGTTTCTAACTAAGT 99315 23 100.0 49 ....................... ACAGATGATAAAGGTAACGTGGCAATAAACATAATGTTTCTAACTAAGT 99243 23 100.0 53 ....................... AATTTGAATTTCCGATTGTTACTCTGACTTTACCAAAATGTTTCTAACTAAGT 99167 23 100.0 49 ....................... TTTACAGTACCAAGATGACTAGACAAATGATTTGTGTTTCTAACTAAGT 99095 23 100.0 50 ....................... TTTAGCTGATTACGTTTATTTGGTTCAGAATTAATAGTTTCTAACTAAGT 99022 23 100.0 52 ....................... TCATGAGATAAACACTCTTTAACATAATCAACCGCGTCGTTTCTAACTAAGT 98947 23 100.0 52 ....................... TCTATATTAACCAACTTTTGAAAGGTATATTTGGCAGGGTTTCTAACTAAGT 98872 23 100.0 53 ....................... AGGTCGTTTTAGAAAATGTCAATTTTTCTCCAGAATTGTGTTTCTAACTAAGT 98796 23 100.0 49 ....................... ATGTCCATCAGTTTTAGGGGTAAAATTTACCCCTAGTTTCTAACTAAGT 98724 23 100.0 50 ....................... TTTAACTATTTATTGGTGTGTTTTTATACACTAAATGTTTCTAACTAAGT 98651 23 100.0 51 ....................... ACAAACATTATACACACCCTGACAATGTTTGGTGTGTGTTTCTAACTAAGT 98577 23 100.0 53 ....................... AACTAAGGAACTTAAATAGGGATTGCGATGATCCGGGCTGTTTCTAACTAAGT 98501 23 100.0 51 ....................... AGGACAAAAAACGGTTTTTTGCACCTAATTTTATTGAGTTTCTAACTAAGT 98427 23 100.0 49 ....................... CAACTCGATTTATGGCGATCGCTAAACCTTCCTGTGTTTCTAACTAAGT 98355 23 100.0 49 ....................... ACTTTTGATTGTTGAATATTTGCGATTTTTAGATAGTTTCTAACTAAGT 98283 23 100.0 49 ....................... ATAAAGCTATTGATAAAATCCACGAATTGCACAATGTTTCTAACTAAGT 98211 23 100.0 50 ....................... TTGACCATTTTTTCTTTTATATGTTAGAATAGGTCGGTTTCTAACTAAGT 98138 23 100.0 50 ....................... CTAATTCATAATTAGATGTACCGTGTTTTCTCTTTTGTTTCTAACTAAGT 98065 23 100.0 48 ....................... TTCGTTAAACAACTAGGTACTAATTATTTTCAAGGTTTCTAACTAAGT 97994 23 100.0 50 ....................... GCCCCTGATTCCTTAGAATCTGGATACAACGGGGACGTTTCTAACTAAGT 97921 23 100.0 46 ....................... AATAAAATTAAACTCAGTATATTTTAGCGCGAGTTTCTAACTAAGT 97852 23 100.0 53 ....................... ATTACATCGAAGAAAATGACACTATTGAGAATGAAGAAAGTTTCTAACTAAGT 97776 23 100.0 49 ....................... TGTCAAAAAATAATAGAACCGTTTACAACGGAGGAGTTTCTAACTAAGT 97704 23 100.0 51 ....................... TGGCAAGTTCACTAATGGGGATTCTATTGATGTAAAGGTTTCTAACTAAGT 97630 23 100.0 51 ....................... TAATCCACCCTCTATGTTTTCTACAAGCCTTACATCCGTTTCTAACTAAGT 97556 23 100.0 53 ....................... GCAAGCATTACTAACCTACCCTCTTTGCTTTGCGTGATGGTTTCTAACTAAGT 97480 23 100.0 53 ....................... TTTCCAATAAACTTTTTATGCAACCTGCCATTCACCTTTGTTTCTAACTAAGT 97404 23 100.0 48 ....................... TTCCTAGAACCTCTCACTGGACGGGTATGGCTTTGTTTCTAACTAAGT 97333 23 100.0 48 ....................... CACATTCTTCGTCACACTATCTGCAAATCCAAAGGTTTCTAACTAAGT 97262 23 100.0 51 ....................... GCTTCCTGCGGTTTTGAAGGAATTGGGGGTATAGGTTGTTTCTAACTAAGT 97188 23 100.0 54 ....................... ACCCTCACTATGATAATGTTGATTTTGATGATTGCTGGGTGTTTCTAACTAAGT 97111 23 100.0 52 ....................... ATTTAGAGGGTGAAGTCGAGTTGTTAAAACTTTGGAGTGTTTCTAACTAAGT 97036 23 100.0 52 ....................... TGACCATAGATTTGATTTCTATTGGTATAGTTGCCGATGTTTCTAACTAAGT 96961 23 100.0 52 ....................... TTAATAAAGAAAATCTGTGGGGTGTGGGGTACTTCAGTGTTTCTAACTAAGT 96886 23 100.0 53 ....................... TTTAAATTATTTAATGGACGTAACTGATAGCCGTCTTTAGTTTCTAACTAAGT 96810 23 100.0 50 ....................... GTTTCAAGCCCGATTACTCTGACTAAAAACAACTGGGTTTCTAACTAAGT 96737 23 100.0 49 ....................... ATAGATGCTTCCATTAACTCACCTTCCTTGCCTTAGTTTCTAACTAAGT 96665 23 100.0 52 ....................... TCTGAAAAGCTATGGGAGGACGAATGATCACAAGCGTTGTTTCTAACTAAGT 96590 23 100.0 53 ....................... CGGTCTTCGCATTGTTGCCAGACTGTCCCATCCTGGGTGGTTTCTAACTAAGT 96514 23 100.0 48 ....................... TAGAATTATTTACCATGAAGGGCAATTTGGAAAAGTTTCTAACTAAGT 96443 23 100.0 52 ....................... TGGCCAGTTCTTTGGCTACGGGTCGCCAATCATCCTGAGTTTCTAACTAAGT 96368 23 100.0 51 ....................... ATTCCATGACCGATGCTATGAAACGGAAACTACTGCCGTTTCTAACTAAGT 96294 23 100.0 50 ....................... TAGTGGTTGCCGTTTTCATGGTTCACGACCACGAATGTTTCTAACTAAGT 96221 23 100.0 49 ....................... GCTAGGATGACTTCTAAGGTCGGTTAATTGGTTTAGTTTCTAACTAAGT 96149 23 100.0 48 ....................... GTAAATACCTTATATGGCGACATGGTCAGCCCATGTTTCTAACTAAGT 96078 23 100.0 50 ....................... CAACCCAAATGGCGGCTATCATGGCTGCCATGGACAGTTTCTAACTAAGT 96005 23 100.0 49 ....................... TTAGTTTTGGCGGCTTTATCGCACTTTTTACTCCCGTTTCTAACTAAGT 95933 23 100.0 53 ....................... TTGAAACATCAAACGAAATTGGAAATTATTAACTATCAGGTTTCTAACTAAGT 95857 23 100.0 50 ....................... CATCCTCAACCATAATCATTAACTCAACTGAAACATGTTTCTAACTAAGT 95784 23 100.0 52 ....................... TTTGTAAATATGTTTTTGGGAATATTTAAAATTGATATGTTTCTAACTAAGT 95709 23 100.0 54 ....................... ATTGAATTATCTAAGAGTAGCGGTAATTTAGAGGGTGAAGGTTTCTAACTAAGT 95632 23 100.0 48 ....................... CTCCCAACTCATGCACTAGTCGAGTCTTTTTGAAGTTTCTAACTAAGT 95561 23 100.0 47 ....................... TTGTCCGATAAAACACTTATTTGCTTATTTAAGGTTTCTAACTAAGT 95491 23 100.0 55 ....................... TATGTGGGGGGAAGATCCCAACGTATCCGGGCTTATCGAGGGTTTCTAACTAAGT 95413 23 100.0 49 ....................... ATTAACCACTTCATGAACCAACAAACCGCGTTAACGTTTCTAACTAAGT 95341 23 100.0 50 ....................... AGCAAAACAGGTTTTGATTGATAGGAAATCAGAGAAGTTTCTAACTAAGT 95268 23 100.0 52 ....................... ATAGATTTACTAATCATATCCTGAGTTGAATCACTCTTGTTTCTAACTAAGT 95193 23 100.0 50 ....................... AGTACACACCATTGCGGAAACTTTCTGCCGTTTAATGTTTCTAACTAAGT 95120 23 100.0 52 ....................... GCTTGAGGTTCACCTTTTACTATAGGGGGTCTTTCACTGTTTCTAACTAAGT 95045 23 100.0 59 ....................... TTGACTTTAGACTTTGATCAAAAATTAGAATTAAAGATTGAGGAAGTTTCTAACTAAGT 94963 23 100.0 52 ....................... AACCCACTTAATTCTGTTAAATCGGCACTGTATAATTTGTTTCTAACTAAGT 94888 23 100.0 52 ....................... TTGCGACCATCAACATAGTTCCGACAATTATTTTCTGCGTTTCTAACTAAGT 94813 23 100.0 50 ....................... TGGACTTGGGAGATCAGATCGTTAACTCCCTTGTCCGTTTCTAACTAAGT 94740 23 100.0 47 ....................... GGGTTCTGGATTTTGTCGATCAGCCGCTCAAATGTTTCTAACTAAGT 94670 23 100.0 0 ....................... | ========== ====== ====== ====== ======================= =========================================================== ================== 131 23 100.0 51 AATCCCCGTAAGGGGACTGAAAC # Left flank : CTCATTATTTATGACTTACCTGACAATAAAGCTGCAAATAAACGCCGGACTCGTTTACATAAAATGCTGAGTGGTTATGGTAAATGGACTCAATACAGTGTGTTTGAGTGTTTCTTAACTGCGGTACAATTTGCTCAGTTGCAAACCAAGATAGAAAAATTGATCAAGTCTGATGAGGATTCTATTAGAATGTATGTACTGGATGCCGGGAGTGTGAAAAGAACTATCACCTATGGTTCGGAAATCCCTAGACAAGAACAGTCTATCATTATATAATTAGTACATCAGCTTAAATTTTTGGCAAACCTAGAGCGGGGTCAAAAACCCCAGGGGTCCGCCAAATCGTCAGAACCTTGATAATTAAATAATTTCAGCGTTTTGTTAGTTTCAGTTGGCAGTTGTTCCGAAGCCTGAAATCAGGTTTTTTCAGAGGTCTGCCAAAATCGTCTCTGGATTCCGCCCCCAGCTTATGTTTCAGATGGCGCGGTTTCTAACTAAGT # Right flank : ATTTAAAATTGATTTTTTTTTAGATTGGTAATCTGATTTGTTTCTAATTAAAGTGGATTTTATCAAATAATGGAGGATAATTTTAGCGGGCAAGACTTGTACTGAGATTGGTCGAAGTATGCCCGCACCACAAGATTTTTATCATTAATATTTGTACTTGAGAATATCGAAAATGGATAATATTTTTGATGCTAAGTAAAGCCGCAGCATATTTTCAATTTACCGTTCTACCGTTTTTTTGTATCTATTTCAGAGATGTCTATTGACTAATAACTAATCCAATCACTCCAACTACCAGCGTAAAGTTTAGCGGTAGAAATTCCAGCTATTGCTAAAGAAAGTAGATTTACACAAGCTGTAATACCAGAACCACAATAAACTAAAATTTCTTTAGTTGTATCTATATTTTCCCAGCGTTGACATTGTTGTAGTTGAGGAAGTATAGCACCGGAAGGGTCAGTTACTTCTTGCCAAGGATAATTAACAGCACCAGGAATATG # Questionable array : NO Score: 5.96 # Score Detail : 1:0, 2:3, 3:0, 4:1.00, 5:0, 6:0.25, 7:-0.29, 8:1, 9:1, # Score Legend : 1: cas, 2: likely_repeat, 3: motif_match, 4: overall_repeat_identity, 5: one_repeat_cluster, 6: exp_repeat_length, 7: exp_spacer_length, 8: spacer_identity, 9: log(total repeats) - log(total mutated repeats), # Primary repeat : AATCCCCGTAAGGGGACTGAAAC # Alternate repeat : NA # Directional analysis summary from each method: # Motif ATTGAAA(N) match prediction: NA Score: 0/4.5 # A,T distribution in repeat prediction: NA [Repeat is AT rich:56.76%AT] # Reference repeat match prediction: R [matched AATCCCCGAAAGGGGACGGAAAC with 92% identity] Score: 4.5/4.5 # Secondary Structural analysis prediction: F [-10.40,-9.10] Score: 0.37/0.37 # Array degeneracy analysis prediction: NA [0-0] Score: 0/0.41 # AT richness analysis in flanks prediction: F [81.7-45.0]%AT Score: 0.27/0.27 # Longer leader analysis prediction: NA # ---------------------------------------------------------------------------- # Final direction: R [0.64,4.5 Confidence: HIGH] # Array family : I-C [Matched known repeat from this family], //