Array 1 1437709-1433254 **** Predicted by CRISPRDetect 2.4 *** >NZ_CP020566.1 Veillonella atypica strain OK5 chromosome, complete genome Array_Orientation: Reverse Position Repeat %id Spacer Repeat_Sequence Spacer_Sequence Insertion/Deletion ========== ====== ====== ====== ======================= ========================================================== ================== 1437708 23 100.0 54 ....................... TCGGCACACCGAAACAATCAGCCAGCTTTTGAAGGCTCGTAAGTTAAATTAAAT 1437631 23 100.0 54 ....................... TCTACGTTTTAACCGTCTCATAAAATTCTGCATATCTTTCTTGTTAAATTAAAT 1437554 23 100.0 51 ....................... TCACTTGATATAGTTGAGCGCTAGTCATTGGTTGTTTTAGTTAAATTAAAT 1437480 23 100.0 58 ....................... CGGATACTACAATTTGGTTATTATTGATCACTACTAATTGTTTCATGTTAAATTAAAT 1437399 23 100.0 52 ....................... CTGATTACGCCACTTACCATGCTAATAATTATGCTGGCGAGTTAAATTAAAT 1437324 23 100.0 55 ....................... CGTTTCACCTTTTACTTCAACTTCGTCAATACATTTAACTGTAGTTAAATTAAAT 1437246 23 100.0 56 ....................... CCATTTTTTGCCAATAAAGCCATAAGCATTTTATTTTGTTCTTTGTTAAATTAAAT 1437167 23 100.0 54 ....................... TCTGCTGATGTCATTACATCTTCAAACTTCATCTAATCACTCGTTAAATTAAAT 1437090 23 100.0 51 ....................... GAAATTGTTATCAATCAACATACGCAACATTGCCTCTGCGTTAAATTAAAT 1437016 23 100.0 54 ....................... TTCTATATTTCGTTTTTGCAATTCGTTATTTCGTATTACCTTGTTAAATTAAAT 1436939 23 100.0 55 ....................... GCCTCAATGCGACCAGCAGATATATTTTGAAGTTGTCTATTGTGTTAAATTAAAT 1436861 23 100.0 56 ....................... TTGTACTTTATTGTTATAACCAACAGCCACACCATGACCACTTGGTTAAATTAAAT 1436782 23 100.0 56 ....................... TCATTAGTATTATTATTTATTGTTGCCACATCGTGGGCGTGATTGTTAAATTAAAT 1436703 23 100.0 55 ....................... CATCACCGTTTTCATCAAACGCATAGTCTGTAGACGCACTTTCGTTAAATTAAAT 1436625 23 100.0 56 ....................... TATCAAAAATACGGAAAGCGATATCGCTGGTATTAAAGCAGAAAGTTAAATTAAAT 1436546 23 100.0 53 ....................... CATATAACAACGCTACACCTAACAATCCTTGCAATAACGCTGTTAAATTAAAT 1436470 23 100.0 52 ....................... ACGCCTTTTAAGAACGCCCAAGCACCACCGCCAAAACCAAGTTAAATTAAAT 1436395 23 100.0 53 ....................... ATGCCTATGATACTATTGCGATTGGTAATGGTGCCTATGTTGTTAAATTAAAT 1436319 23 100.0 54 ....................... TTAATATAGCATTAACACCATCAATACTCACCTCATATTTAAGTTAAATTAAAT 1436242 23 100.0 55 ....................... TAACTCTTCTCGTGTAGTTTGTCCCACGTTGTATGTCATATTAGTTAAATTAAAT 1436164 23 100.0 52 ....................... TTTGTTGCGTTGTAACAATGCTTGCATATCTGCTTCTAATGTTAAATTAAAT 1436089 23 100.0 55 ....................... TGAAGTACTTCCCCTCAAAGGATTGCTCTAATCCTAGTATTTCGTTAAATTAAAT 1436011 23 100.0 55 ....................... TAATGTGTTAAAGTCGGTATATTCGTATCTATTGCCCTTTGCAGTTAAATTAAAT 1435933 23 100.0 56 ....................... ATTCATCTGTTAGCCTTTCACGACCTACGATATAAAACCGCTTGGTTAAATTAAAT 1435854 23 100.0 55 ....................... ATTTTCTTGTGTATGTCTTTCATCTTTAACCCATTTCAATGATGTTAAATTAAAT 1435776 23 100.0 52 ....................... TTCATAATTCCTCCCGTTGATAAATAAAAAACCGTATGATGTTAAATTAAAT 1435701 23 100.0 56 ....................... TCTCTAATGTATTCAAATGTATTACAATCATCTGTATCAAAATCGTTAAATTAAAT 1435622 23 100.0 54 ....................... AAAAATTTTCTTATACATGTTTGTGTGGTTTCCTTTCTTTTGGTTAAATTAAAT 1435545 23 100.0 55 ....................... AATATCTTGTTCATTCATGTAATTAATAAGTTCGTTATAGCCAGTTAAATTAAAT 1435467 23 100.0 56 ....................... TAATAATAGTGAGTAATCGCATTACATTTCTCCCGTGATCATCAGTTAAATTAAAT 1435388 23 100.0 54 ....................... AGGCTGCTAATGCTTGGCGATTGTTCGCCGCTTTTCCAACGGGTTAAATTAAAT 1435311 23 100.0 55 ....................... CCGAATTCCATTAGAGTTTGATAATTTTCAGAGAAAAACTTGAGTTAAATTAAAT 1435233 23 100.0 57 ....................... CATGTTATACCTCGCTTTCATATCTGTTCCACAATTCACACATATGTTAAATTAAAT 1435153 23 100.0 56 ....................... TTAATAGCGGTTATATCTGTATGAAATTATCAAAGACCCCTAAAGTTAAATTAAAT 1435074 23 100.0 54 ....................... CTACCCAGCCAATCACGCCTATAATGTCAATAATTTTCATTCGTTAAATTAAAT 1434997 23 100.0 58 ....................... AGTTTCTCTGATGCGGTCTAAGAATAATTCTCTTGCTTCATCAGGGGTTAAATTAAAT 1434916 23 100.0 57 ....................... TTTAACTTTATTTCCGTCTGCGTCTAGGATATTGACAGTAGGGCGGTTAAATTAAAT 1434836 23 100.0 55 ....................... ATACTCGTCAGAAAGCGTAGATTGCACACATTCCGATTTATCAGTTAAATTAAAT 1434758 23 100.0 58 ....................... TTTTACCTTGCTTTCATACTCAAACCCAGTTTTGAATAGTGTTAAAGTTAAATTAAAT 1434677 23 100.0 52 ....................... TTGATTAAAGTTTCTTCTTCCATTCTCCTTTAAACTATAAGTTAAATTAAAT 1434602 23 100.0 55 ....................... AATACCGTAGCCGATGTGCAAAACTCTGTAGCGTTGGGAACTAGTTAAATTAAAT 1434524 23 100.0 56 ....................... TATATCGTAGACTTTTTGGATATGGTTACGAATGTTAATATAGGGTTAAATTAAAT 1434445 23 100.0 53 ....................... ACACCCTTTGTATTCGCCAATGGTACAATAAAATTGTTACCGTTAAATTAAAT 1434369 23 100.0 56 ....................... TCCAAGATAGCTTTGAAATCAATAGTTTGTACTGTTGCTTTTTGGTTAAATTAAAT 1434290 23 100.0 55 ....................... CGAACGCCCTTTTCATTGGCAATAGGTACTACATAATTGGAACGTTAAATTAAAT 1434212 23 95.7 56 ..............A........ CCCTTTGCACTTTTAACTACATCAGTTAAAGGTACGACTAAAGAGTTAAATTAAAT 1434133 23 100.0 55 ....................... ATGATGTGAAACGTCAATTATTAACGCTTTATCTTTTATTGTGGTTAAATTAAAT 1434055 23 100.0 54 ....................... TGTATCTTTATTTCTTGCGTTGCGTTTAATTGCTAAAATACCGTTAAATTAAAT 1433978 23 100.0 56 ....................... CCTTTAATAATGAATAAATTGTTCATGATAAACTCCTTTTCTGCGTTAAATTAAAT 1433899 23 100.0 54 ....................... CCGATGCAGGCGCACCGCATAGTACGCATTGGCCGTTATCTCGTTAAATTAAAT 1433822 23 100.0 56 ....................... TACCAATAATTACTGAGAATTAATAATGTGAATCCTAATAGAATGTTAAATTAAAT 1433743 23 100.0 54 ....................... AAATTCGTTAATTCTTGCATGTGTTCTCCCTGTGGTTTGATTGTTAAATTAAAT 1433666 23 91.3 54 ........G.........A.... AGGGCGAACACAAAACCGCCAATATTTTGAATTATGTTTATAGTTAAATTAAAT 1433589 23 87.0 56 ...T....G.....A........ TTTATAGCGTATTTTTTACGTAGCCATGCAATTTTCTGACACTTGTTAATTTAAAT 1433510 23 87.0 56 ....T.T..............T. AATTTCTCCTTGTGTTAAAATACAAGTAGAGTAATAGCAAAATCGTTAAATTAAAT 1433431 23 91.3 57 ........G.........A.... TTTTTAGATTTCAGAAATTCGATATATTCAACTGCTTTTTGTAAAGTTAAATTAAAT 1433351 23 100.0 52 ....................... TCGGCGATTTCTGCTGATGTCATCACATCTTTAAATTTCATCTAAGTTAAAT 1433276 23 78.3 0 .G..T.A.........T....G. | ========== ====== ====== ====== ======================= ========================================================== ================== 58 23 98.8 55 AATCCCCTAATGGGGACGGAAAC # Left flank : GATATGGCGTACGTGTTCAGAAATCTGCATTTGAGGCATTGCTCAATAGAAAACAATACGATGTAATGATGCGTCGGGCGAGTCGAATTATTAATCCAGTAGAGGATTCTCTACGAGTATATATACTTGATGATATTATTAATATTTATACATGGGGGATTGGCGAACGGAAAGAGCAAGATTGTATCATATTGTAATGCATTGATTAGAAATATTATTTAATAACCAATAGTAGAATTATCTTTGTTTTATTAGTTGCATATATCTAATGTACTGGTACTGGTAATTCTACTATTGTATTTTTTTTGTTTTTTTATGCTATAATATATCTAGATTATAACCTTGTGAAATAAATCTCCGCCGTTGTGATAGTGGCGCGATTTATAGGTGTTATTTTAGCACGCTAAAGTGCTATTTGAGGCTCATTTATGATCTCCGCCGTTAATGGTGATTTTGAACTAGGTAACATCTATTGTTTCAGATACAGGGTTAAATTAAAT # Right flank : TAAATTTCTATCCATGTTTCTGTTGATTCAAATATGTTAAATTAAACTATCTCCCGAAATATAATTTTCGAAACTCATTATATATTTGGGAAGTTTTACTAGTTGTCTGTTTATGGACTGCGTTACATGAAAAAAGTAGCATTACTATCCATAATATAGATCACTCGGCATATGCCATCTGTGTCTATACGTTAGTAATGCTACTTTTGTCCTATAACCCAGATTAAATATTTTATTACTTTAATTTCATTAGATATGCATTTAGCATGTCTAATCGTTCAGCAAATAATGTTTTCATCATAGGCAGACGTTCTTCCGTAATATTTGGGTTTTTTGCATATATGGAATCCATCAATTCCATCGCTGTTTTAGATAATGACTGTGGAATTGTTATCGGTGTTGTTACATACTTTATTTGCTTATCATGTTTCGATTTAAACGGTAATGATGGATACGTATGAAATGGTCTATGTGGATTAATCGTCATTTTGTTGTACCAT # Questionable array : NO Score: 5.50 # Score Detail : 1:0, 2:3, 3:0, 4:0.94, 5:0, 6:0.25, 7:-0.69, 8:1, 9:1, # Score Legend : 1: cas, 2: likely_repeat, 3: motif_match, 4: overall_repeat_identity, 5: one_repeat_cluster, 6: exp_repeat_length, 7: exp_spacer_length, 8: spacer_identity, 9: log(total repeats) - log(total mutated repeats), # Primary repeat : AATCCCCTAATGGGGACGGAAAC # Alternate repeat : NA # Directional analysis summary from each method: # Motif ATTGAAA(N) match prediction: NA Score: 0/4.5 # A,T distribution in repeat prediction: NA [Repeat is AT rich:62.86%AT] # Reference repeat match prediction: R [matched AATCCCCGAAAGGGGACGGAAAC with 92% identity] Score: 4.5/4.5 # Secondary Structural analysis prediction: F [-9.70,-8.90] Score: 0.37/0.37 # Array degeneracy analysis prediction: R [20-0] Score: 0.41/0.41 # AT richness analysis in flanks prediction: F [75.0-61.7]%AT Score: 0.27/0.27 # Longer leader analysis prediction: NA # ---------------------------------------------------------------------------- # Final direction: R [0.64,4.91 Confidence: HIGH] # Array family : I-C [Matched known repeat from this family], //